Olá Igor Vieira, se finalizou o processo e ativou o canal, deveria funcionar. Só para confirmar:

Quando edita informação da conta no Zendesk, a mesma depois aparece ao visualizar a conta no WhatsApp? Se não, o melhor seria submeter um ticket para a equipe do Zendesk ver em detalhe
A resposta automática não inclui nenhum conteúdo dinâmico, certo?
No Zendesk Chat você ativou o chat para pelo menos um grupo?

Lamento não ser de grande ajuda por agora, mas qualquer informação adicional que ajude a entender melhor a situação, agradeço desde já!